Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms