Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms