Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms