Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms