Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms