Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms