Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNPLA3Q9NST1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms