Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms