Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms