Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms