Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms