Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms