Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms