Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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