Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF1Q9H7N4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms