Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms