Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms