Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms