Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms