Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms