Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC94Q9BW85 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC94Q9BW85 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms