Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms