Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms