Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms