Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms