Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMNAT3Q96T66 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms