Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms