Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR78Q96P69 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms