Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP3Q96P47 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms