Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms