Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms