Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP53Q96M91 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms