Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms