Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNDP1Q96KN2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms