Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms