Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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ZBED3Q96IU2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
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ZBED3Q96IU2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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ZBED3Q96IU2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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ZBED3Q96IU2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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ZBED3Q96IU2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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ZBED3Q96IU2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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ZBED3Q96IU2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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ZBED3Q96IU2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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