Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms