Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms