Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms