Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms