Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO1Q92973 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TNPO1Q92973 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNPO1Q92973 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNPO1Q92973 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNPO1Q92973 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TNPO1Q92973 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNPO1Q92973 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TNPO1Q92973 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TNPO1Q92973 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNPO1Q92973 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TNPO1Q92973 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNPO1Q92973 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO1Q92973 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms