Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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C15orf40Q8WUR7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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C15orf40Q8WUR7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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C15orf40Q8WUR7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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C15orf40Q8WUR7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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C15orf40Q8WUR7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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C15orf40Q8WUR7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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C15orf40Q8WUR7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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C15orf40Q8WUR7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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C15orf40Q8WUR7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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C15orf40Q8WUR7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C15orf40Q8WUR7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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