Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms