Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP38Q8NB14 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP38Q8NB14 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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