Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms