Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FSIP1Q8NA03 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms