Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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