Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTROBQ8N137 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTROBQ8N137 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTROBQ8N137 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTROBQ8N137 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTROBQ8N137 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTROBQ8N137 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTROBQ8N137 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTROBQ8N137 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTROBQ8N137 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTROBQ8N137 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTROBQ8N137 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms