Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0V5

GCNT2, N-acetyllactosaminide beta-1,6-N-acetylglucosaminyl-transferase, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT2Q8N0V5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT2Q8N0V5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GCNT2Q8N0V5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GCNT2Q8N0V5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GCNT2Q8N0V5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GCNT2Q8N0V5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GCNT2Q8N0V5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GCNT2Q8N0V5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT2Q8N0V5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms