Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms